Ну, 9.5 - достаточно новая версия. У нас на одном из проектом интернет-магазин тоже на 9.5 и в принципе особенных проблем не наблюдается. Правда следует отметить, что накладные печатаем из 1С, а не из Битрикса... но это я отвлёкся.

Если при попытке напечатать в хроме накладную в правом верхнему углу (в правой части адресной строки вы видите значок , то весьма это означает, что было заблокировано всплывающее окно (или несколько). Нажмите на этот значёк и выберете разблокировать всплывающие окна. Так же возможно стоит добавить при этом данный сайт в перечень исключений, не блокируя на нём всплывающие окна никогда.

Если вы хотите разблокировать всплывающие окна в принципе раз и навсегда, то выберите значок . Далее Параметры (в некоторых ОС настройки) -> расширенные -> Конфиденциальность -> Настройки содержания -> в разделе "Всплывающие окна" выберите "Разрешить всплывающие окна для всех сайтов". Чтобы настроить разрешения для отдельных сайтов, нажмите Исключения...

Несмотря на внешнюю лакончиность и удобность настройки в Chrome иногда поражают витиеватостью и не интуитивностью. Впрочем, Internet Explorer 8 гораздо хуже... IE 9 и FireFox 4 ещё не пробовал, так что не могу сказать сделан ли там этот процесс более удобно.